Benjamín Serrano Barba, estudiante del programa de Doctorado en Ingeniería Informática Aplicada, se encuentra realizando una importante estadía de investigación en el Laboratorio de Biotecnología Microbiana del Centro de Micro-Bioinnovación (CMBi) de la Universidad de Valparaíso. La estadía, que se desarrolla entre el 17 de marzo y el 30 de noviembre de 2025, es supervisada por el Dr. Alejandro Dinamarca Tapia, profesor titular del centro, y cuenta con el respaldo del académico del claustro, Dr. Rodrigo Olivares Ordenes.
Su investigación, titulada "Informática aplicada al desarrollo u optimización de nuevos algoritmos inspirados en circuitos de regulación de la expresión génica de bacterias", busca desarrollar una formación doctoral interdisciplinaria a través de la integración activa en un equipo de alto rendimiento. Este proceso formativo incluye la participación en talleres prácticos, seminarios especializados y análisis de casos para co-construir conocimientos en microbiología molecular, conducta bacteriana, bioinformática y algoritmos inspirados en procesos biológicos, contribuyendo directamente al proyecto ANID Exploración 13220184. El núcleo del problema abordado es entender cómo una bacteria ajusta la expresión de sus genes frente a variaciones de temperatura, es decir, cómo el ADN se traduce en ARN de manera diferente dependiendo del contexto térmico.
Para ello, la investigación se enfoca en interpretar y analizar datos biológicos derivados de experimentos con bacterias, aplicando expresiones matemáticas e informáticas para comprender la expresión diferencial de genes. La estadía ha sido descrita como una "instancia altamente enriquecedora para el desarrollo académico y profesional" y una "experiencia transformadora", permitiendo una integración fluida en las líneas de investigación del laboratorio. Entre los logros concretos destacan el desarrollo de una plataforma bioinformática para integrar y analizar datos de RNAseq, el establecimiento de un prototipo integrado bioinformático para modular la formación de biofilms y controlarlo mediante un algoritmo y hardware bio-inspirado, la elaboración de una mini-review sobre sistemas de regulación bacteriana y la redacción de un artículo científico.
A futuro, se propone avanzar en la validación experimental de los algoritmos diseñados y en la ampliación de la plataforma bioinformática con nuevas capas de análisis multiómico, proyectando un amplio horizonte de colaboración y desarrollo científico que potenciará la transferencia tecnológica y la publicación de resultados de alto impacto.
